Kereta api ini dinamakan KA Senja Utama Yogyakarta dikarenakan jadwal keberangkatan yang selalu di malam hari.Selama perjalanan kereta api berhenti di beberapa stasiun diantaranya: Stasiun Jatinegara, Cirebon, Purwokerto, Kroya, Gombong, Karanganyar, Kebumen, Kutoarjo dan Stasiun Wates.
Ditjen KA, Kemenhub RI: Nomor pada jadwal: 135-136: Peta rute; Lintas tengah Jawa (koridor Jakarta-Yogyakarta-Surakarta) Untuk Kereta api: Mulai 1 Juni 2023 . Sawunggalih relasi Pasar Senen KA Senja Utama Yogyakarta hanya berhenti di Jatibarang untuk mengarah Yogyakarta;
9JtTQ.